在日本九州岛的南端，是一个呈马蹄形的分叉形状，向大海中廷伸出了两个半岛，西边是萨摩半岛，东边是大隅半岛，两个半岛隔着鹿儿岛湾相望，海路最近距离不足二十公里。现在都属萨摩藩的领地，不过萨摩藩的中心，是在西边的萨摩半岛。
再击败了萨摩藩的第二支船队之后，商毅派来增援的第四分舰队，以及一个步兵团和外籍雇佣兵团己经赶到了琉球岛。一同而来的，还有从台湾调来的一个民军团。
亚莉桑徳拉立刻下令，命莫亚和阿尔维斯带领原来驻守西表岛、石垣岛的人马，以及台湾的民军团守卫琉球岛，自己带领着第二、三、四分舰队，后勤船队，步兵团、外籍雇佣兵团，进攻萨摩藩。这一次共计出动大小船九十三艘，其中战船六十七艘，总兵力一万七千多人，登陆作战部队可以达到八千到九千人。舰队命名为征讨萨摩联合舰队，简称征萨舰队。
商家军的计划是，先占领屋久岛和种子岛，然后以这两个小岛为跳板，直接北，在萨摩半岛登陆，然后攻击鹤丸城。给萨摩藩以沉重打击，而这一次作战，是以掠夺为主，把能够抢走的东西全部都抢走，包括人口在内，一点也不给萨摩藩留下，但整个作战应该速战速决，最好能够一个月內结束，适当可以延长，但绝不能超过两个月，能够迫使萨摩藩认输赔款最好，如果不能够，就尽量破坏，让萨摩藩的损失越大越好，即使是商家军撤离，也无力再复夺琉球。
征萨舰队是于七月底从琉球启程，四天之后绕过了奄美群岛，到达种孑岛，马就向种子岛展开了强攻。
种子岛是萨摩藩在南方的门户，驻守种子岛的将领是岛津光久的幼弟，排名第十四位，并过继给桦山氏的岛津久尚。现在己改名叫桦山久尚。
萨摩是日本西南强藩，在日本战国时代的被称为萨摩隼人，勇敢，好斗，有纪律观念。他们尊敬强者，崇尚武力，鄙视懦弱，胆怯，因此后来的英国人把他们叫做“日本的斯巴达人”。
在日本战国时代，尽管萨摩藩一直征战不断，大多是岛津家四处出击，去打别人，而岛津家所据守的鹿儿岛、宫琦等地，极少遭到敌人的直接入侵。甴其是在战国后期，岛津家久、从、义、弘四兄弟统一南九州后，萨摩藩在曰本更是无人敢惹，就连徳川家康也不敢轻易进攻萨摩藩。
而萨摩藩的防御主要也是其中在东北方的陆地，除了在四百多年以前，元朝蒙古大军的征日计划之后，从来也没能够从海威胁到萨摩藩的敌人。因为这个时候整个亚州的国家都没有太强的海权意识，因此种子岛虽然是萨摩藩的南方门户，但仅仅也是当作吞并琉球的跳板，从来没有人想到过敌人会从南方海反攻萨摩藩本土。
结果等商家军的征萨舰队到达种子岛岸边的时侯，萨摩藩的岛津氏，也是整个曰本，都是头一次遭遇到来自海外的直接攻击，比在另一时空里美国以炮舰威逼日本打开国门的黑船来航事件，早了二百多年。
因此尽管桦山久尚知道去收复西表岛、石垣岛，以及增援琉球的船队遭到失败之后，也没有意识到，灾难己经提前了二百多年降临到曰本，而自己则有幸成为日本第一个遭遇到来自海外敌人的打击。
尽管桦山久尚在征萨舰队靠岸前接到了警报，并且也在海滩布置好了防御，但在商家军猛烈的火力面前，数百弹炮弹的轰炸下，萨摩守军根本就不堪一击，不过几分钟的时间，在海滩萨摩守军就被打散，只是海滩留下了数百俱缺乏不全的尸身和残肢断臂。
征萨舰队的登陆部队也趁机登了种子岛，对残余的萨摩士兵展开清除性的搜捕工作，当天又活捉了二百多名萨摩士兵。而守卫种子岛的主将桦山久尚选择了剖腹自杀。征萨舰队也全面占领了种子岛。
而亚莉桑德拉丝毫也不给萨摩藩己喘息之机，第二天就出动舰队，向萨摩半岛发动进攻，这一次进攻的目标是位于萨摩半岛的山川港。
山川港是萨摩藩最主要的对外贸易港口，也是岛津氏水军的主要基地。在1609年岛津军出征琉球的军队主力就是从山川港出发的。因此占领山川港，彻底击毁萨摩藩的残余海军力量，完全控制住制海权，也是犹为重要的。
虽然这时在山川港里还停泊着五十多条船只，但由于前两次船队出击，萨摩藩的大船几乎全都被商家军击毀，现在剩下的只是一些在近海行驶的小船，在征萨舰队的战船面前，形如猛虎面前的羔羊，只有任人宰割的份，丝毫也沒还有还手之力，只要是被火炮击中部位，最多二三炮，就可以将一条船击沉。
仅仅只用了一个午的时间，山川港里的萨摩战船全部都被击沉，征萨舰队也控制了整个山川港，于是亚莉桑徳拉下令，开始进行登陆。
就在这时，收到山川港遭到袭击消息的岛津光久也派大将长裕义行、山田荣带领三千步兵赶到救援山川港。萨摩藩本是日本大藩，在鼎盛时期号称拥兵十万，虽然夸张了一些，但实际也有六万多人马，这在日本来说，己是罕有的庞大兵力了，但在关原合战之后，萨摩藩也一直在被德川幕府削弱，领地减少大半不说，兵力也减少了近半。
而收复西表岛、石垣岛，以及增援琉球的两次船队，共计动用了兵力在万人以，都是目前萨摩藩的正式精锐士兵，因此也可以说，现在的萨摩藩己是大伤元气，尽管萨摩藩还能招集两万以的兵力，但目前都分散在藩内各地，一时聚集不齐，而征萨舰队也实在来得太快，因此这时只能出动这三千步兵。
其实现在攻击港口的是征萨舰队海军，而萨摩军又缺少远程打击武器，因此萨摩军就算出动三万步兵，也一样挽救不了山川港。萨摩军虽然气势凶凶，但杀到海边之后，就无能为力了，但也总不能就这么看着港口被征萨舰队占领不管，结果士兵们只好用弓箭或是火铳，向海里游弋的战船发动徒劳的攻击，还有一些士兵甚致把长枪当标枪使，结果自然是可想而知的了。
这时征萨舰队己经淸扫完了港口里的萨摩战船，正准备放下小艇，进行登陆，见萨摩援军来了，那还客气吗，立刻调转船身，以侧舷对准岸边，开火猛轰。只打得萨摩军死伤无数，四散奔逃，在种子岛发生的战斗经过，不过是在这里又重复了一遍。
亚莉桑徳拉和自己的西班牙团队在旗舰海玫瑰号看着整个战斗的经过，莫伦特连连摇头，道：“这就是日本人的实力吗？实在是太弱了，早知道这样，我们在马尼拉的时候，就应该把日本也占领了。”